2016年第39-40周（9月26日至10月9日）全省新增登革热病例73例，其中境外输入病例5例，本地病例68例。新增本地病例分布在广州市37例（荔湾区12例、南沙区9例、越秀区和花都区各5例、天河区和海珠区各2例、白云区和番禺区各1例），潮州市17例（潮安区15例、湘桥区和枫溪区各1例），佛山市8例（南海区5例、顺德区3例），汕头市4例（潮南区3例、潮阳区1例），清远市2例（清城区和佛冈县各1例）。近两周新增本地疫点是潮州市湘桥区、枫溪区，清远市清城区、佛冈县和汕头市潮南区。
    截至10月9日，本年全省共有16个地市报告381例登革热病例，较2015年同期（1330例）下降71.35%，无死亡病例。其中，境外输入病例102例，本地病例279例。381例病例分布在：广州市143例，潮州市130例，佛山市29例，深圳市24例，中山市14例，汕头市11例，珠海市8例，清远市7例，东莞市6例，湛江市和茂名市各2例，韶关市、江门市、肇庆市、惠州市和汕尾市各1例。